В фильме Аннигиляция зрители становятся свидетелями невероятных событий, начавшихся с падения небольшого метеорита на Землю. Это космическое тело врезается в заброшенный маяк, что запускает цепь загадочных и необъяснимых изменений в окружающей местности.
Аннигиляция рассказывает о профессоре биологии Лине, которая уже целый год скорбит о пропавшем без вести муже. Её жизнь кардинально меняется, когда она присоединяется к опасной научной экспедиции, отправляющейся в загадочную зону, известную как Сияние. Эта территория постоянно расширяется и преображает всё живое внутри своих границ, создавая причудливые гибриды растений и животных.
Команда исследовательниц сталкивается с аномальными явлениями, которые бросают вызов всем законам физики и биологии. По мере продвижения вглубь этой таинственной территории, учёные начинают терять не только связь с внешним миром, но и собственную идентичность. Аннигиляция предлагает зрителям философское размышление о природе изменения, самопожертвования и границах человеческого сознания, сохраняя напряжённую атмосферу на протяжении всего повествования.